由于胰高血糖素是29个氨基酸残基组成的单链肽，以 N-末端组氨酸为起点、C 末端苏氨酸为终点 ，很多氨基酸残基都暴露在外面，受体主要在肝，肾也有降解作用。

H2N-组氨酸1-丝氨酸2-谷氨酰胺3-甘氨酸4-苏氨酸5-苯丙氨酸6-苏氨酸7-丝氨酸8-天冬氨酸9-酪氨酸10-丝氨酸11-赖氨酸12-酪氨酸13-亮氨酸14-天冬氨酸15-丝氨酸16-精氨酸17-精氨酸18-丙氨酸19-谷氨酰胺20-天冬氨酸21-苯丙氨酸22-缬氨酸23-谷氨酰胺24-色氨酸25-亮氨酸26-甲硫氨酸27-天冬氨酸28-苏氨酸29-COOH

①氨基酸少，并且衍生物同源性极高【胰高血糖素（1-29）是通过用激素原转化酶2处理胰高血糖素原产生的 ,分子量为3485Da ；胰高血糖素样肽-1（GLP-1），胰高血糖素样肽-2（GLP-2），肠高血糖素和胃泌酸调节素来源于激素原转化酶1处理的胰高血糖素原】 。
②多物种间的胰高血糖素序列具有高度同源性，难以找到高特异性的抗体。
③多肽不稳定，容易被氧化还原、容易聚集纤维化 、容易被某些蛋白酶水解使其失活 。
④需要的样本量大，样本通常需要经过纯化处理。基于胰高血糖素极度的不稳定，对其进行体外研究实验前必须要有保护其稳定的方案。目前广州市yh533388银河生物科技有限公司研发出胰高血糖素的保护剂并为其申请专利。该保护剂主要用于血液样本中胰高血糖素的保护，自身性能稳定，同时对提高胰高血糖素的稳定性有明显作用。

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